介绍

平台介绍¶

校级高性能计算平台，由 arm 和 x86 两类芯片架构的CPU节点组成，作业调度系统采用的多瑙（Donau Scheduler）。

使用指南¶

• 在满足本实验室正常使用的情况下，面向全校师生开放使用，每学年4次集中考核、申请；收费标准

• 禁止在登录节点运行作业，登录节点运行的程序使用CPU或内存超标会被监控程序杀掉。所有作业应由多瑙作业调度系统调度至计算节点运行，多瑙使用文档见 多瑙使用。

• 多瑙作业资源申请规则及注意事项：

  • 多瑙作业申请资源时需遵守资源申请的基本规则，即申请的CPU核心数和程序使用的线程数相等，避免集群资源的浪费或者节点负载过高，如果违反规则导致资源大规模浪费，账号将会被暂停提交作业一段时间或降低可使用的核心数；

• 每个用户可使用的计算和存储资源有一定限制。数据较多、作业任务较多的用户建议时常使用 diskquota 命令查看自己的存储使用量，以免因为存储空间达到配额限制导致程序挂掉。存储超配额后，无法写入数据，同时也无法登录集群，均会出现 Disk quota exceeded 的报错。

• 集群存储只存储用户目前使用的数据，结果数据应该及时下载到本地，计算中间数据及时删除。测序原始数据一定要在本地备一份。长时间不使用的数据及时压缩后备份到本地，避免额外的存储使用费用。删除数据前请仔细确认，集群上的数据删除后不可恢复。

• NR、NT等生信数据库目录 /share/software/biodb/。

• 大批量的群体数据处理时，不要直接保留sam文件，见 短序列比对输出bam, 数据使用规范 。群体数据处理过程中会使用大量的存储空间，建议群体数据处理过程中时常使用 diskquota 命令查看自己的存储使用量，以免存储使用达到配额限制导致程序挂掉或空跑。